Raphaël posseda le corps d'une personne du nom de Donnie Finnerman dans une station service, qui fut détruite par la puissance de Raphaël. Le receptacle de Raphaël a été laissé dans un état catatonique après son retour au ciel. Toutefois, Castiel est en mesure d'invoquer Raphaël, pour l'interroger sur l'endroit où se situe Dieu, tout en l'emprisonnant derrière un mur de flamme sacrée grâce à une huile sainte que Castiel a obtenu à Jérusalem.

Raphaël raconta à Castiel et Dean que Dieu est mort, et que les hôtes célestes sont fatigués d'attendre son retour et décide d'implanter le paradis sur Terre. Castiel voulu alors savoir qui l'avait ressuscité, Raphaël lui expliqua que c'était surement Lucifer qui l'a ressuscité car Lucifer a besoin de tous les anges rebelles pouvant lui servir. Raphaël raconta à Dean, qu'il est plus puissant que Zachariah et qu'il est capable de faire des choses dont celui-ci ne peut imaginer, car Zachariah n'est pas un archange.

Dean et Castiel décidèrent de partir en laissant Raphaël dans le cercle de feu, celui-ci les menaça de traquer Castiel s'il le laissait dans le cercle, mais Castiel décida d'ignorer ses menaces.

Sam et Dean rencontrèrent Zachariah quand celui-ci effaca leur mémoire et qu'il les transforma en simple employée de bureau, mais leurs vrais vocations les rattrappera et Zachariah restaura leur mémoire en disant à Dean, qu'il ne peut pas se passer de cette vocation.

Après la confrontations de Sam face à Lilith, Zachariah apparait devant Chuck Shirley après que celui-ci est eut une nouvelle vision. Et voulait l'empêcher de prévenir Sam et Dean sur se qu'il a vut dans sa visions, Chuck menaca Zachariah de se tuer, mais celui-ci lui apprend qu'il peut le ramener à la vie et disa à Chuck d'écrire ce qu'il a vut.

Zachariah réaparaitra dans le dernier episode de la saison 4 de Supernatural, avec Castiel et prenna Dean en otage pour but de le préparer pour l'apocalypse. Zachariah admettra à Dean que ils ne veulent pas empêcher Lilith de détruire le dernier sceaux qui libéra Lucifer, et que les anges veulent que l'apocalypse soit déclencher afin de vaincre Lucifer et d'apporter le paradis sur Terre. Il révele aussi que Dean devra tuer Lucifer lorsque celui-ci sera libre.

Castiel aidera Dean à s'échapper et d'empêcher Sam de tuer Lilith. Zachariah arriva pour arrêter Castiel, mais celui-ci utilise un sceau à partir de son sang pour renvoyer Zachariah au loin.

Zachariah arriva chez Chuck avec deux autres anges dans une tentative de forcer Dean à les suivre. Cependant Dean renvoya aux loin Zachariah et c'est ange grâce à un sort que Castiel lui a apprit. Zachariah envoya une vision à chuck pour que celui les envoie dans l'endroit où Zachariah alla les retrouver. Celui-ci avoua à Dean que celui-ci est le receptacle de Michael, et tenta de le forcer à donner la permission à Michael, en torturant Sam jusqu'a qu'il accepte. Castiel arriva et sauva Dean et Sam et tua les 2 anges de Zachariah et mit celui-ci en fuite.

Ensuite Zachariah envoya Dean en 2014, pour qu'il voit ce qui arrivera s'il il refuse d'autoriser Michael à posséder son corps, il n'est pas clair si ce futur est vrai o^qu'il soit altérée par Zachariah. Après la confrontation de Dean avec Lucifer, Zachariah ramène Dean dans le présent. Lorsque Dean refusa toujours d'être le receptacle Michael, Zachariah était sur le point de l'emmener en captivité, Castiel téléporta Dean aux loin.Il monta un plan se servent d'Adam comme appat pour attirer Dean , il a dit oui,mais il Tue zachariah et parti avec sam avant que michael arrive,Adam lui ne sens n'est pas sortit .

Uriel apparaissa avec Castiel, et semble désireux de faire dîsparaitre une ville afin que le sceaux qui retient Samhain ne soit pas briser, et il laissera du temps à Sam et Dean pour empêcher cet évenement. Plus tard, il est révélé que que Castiel et Uriel devait obéir aux ordre de Dean, car cet évenement était un test pour évaluer les compétances de Dean.

Uriel réapparaissa avec Castiel, pour tuer Anna Milton. Mais celle-ci réussira a les renvoyer aux ciel temporairement. Plus tard, Uriel apparaissa dans le rêve de Dean et lui exigea de lui remettre Anna, et lui révéla qu'il a la grâce de celle-ci. Ensuite Uriel et Castiel les retrouvèrent en même temps que les démons, et un combat se déroula et Anna réussisa à récupérer sa grâce en la volant à Uriel.

Uriel sera promus au-dessus de Castiel, par ses supérieurs hiérachiques, car Castiel avait de l'empathie pour Dean. Uriel kidnappa Dean, pour l'obliger à tortuer Alastair, pour que lui et Castiel découvre la personne qui tuaient les anges. Mais c'était en faite Uriel qui était le responsable des meurtres, car il recrutta des anges pour sa cause qui était soutenir la libération Lucifer et ua tout les anges qui refusa. Il libéra Alastair et voulait tuer Dean, quand il admetta son plan à Castiel, il lui proposa de le rejoindre, mais celui-ci refusa. Alors il attaqua Castiel, et celui-ci sera sauver par Anna qui apparaissa et tua Uriel.Anna faisa appelle aux Uriel du passé, lorsqu'elle remonta le temps en 1978, pour qu'il l'aide à tuer les parents de Dean et Sam, pour empêcher la naissance de Sam. Elle menta à Uriel en lui disant que c'était les frères qui le tuerait dans l'avenir. Toutefois, Michaël intervena et tua Anna et renvoya Uriel dans le ciel.

Anna Milton est incarcéré dans un hôpital psychiatrique, parce qu'elle avait tenté d'avertir les gens sur l'Apocalypse qui est à venir et elle entendait également des voix qui était en faite les conversation des anges. Elle sait que Lilith veut détruire les 66 sceaux pour libérer Lucifer, un démon essaiera de la capturer, mais grâce à ses pouvoirs elle réussira à ses pouvoirs. Ruby alertera Sam et Dean qui découvriront qu'elle c'est réfugiée dans l'église où travaillait son père. Quand les frères la retrouveront, elle disa qu'elle l'est connaissait et que les anges parle d'eux. Le démon Alastair apparaissa et attaqua les frères, Ruby parta mettre Anna en sécurité.

Plus tard, les frères retrouvèrent Anna et Ruby, mais Castiel et Uriel les retrouveront et essaieront de tuer Anna, et pendant que Sam et Dean les affrontent, Anna jeta un sort qui les renvoya au ciel. Plus tard grâce à Pamela , ils découvriront que Anna est en faite un Ange , qui était l'ancien chef de Castiel et d'Uriel et qui à décider d'arracher sa grâce pour devenir humaine, elle décidera de la retrouver et partira avec les Winchester pour l'obttenir.

Sam localise la grâce de Anna qui était dans un arbre, mais en s'y rendant ils découvrirent que sa grâce avait disparu et quelqu'un l'avait prise. Elle entendra une conversations des anges qui disait que si il ammené pas Anna, Dean serait renvoyée en enfer. Lorsque Dean et Sam iront trouver Uriel et Castiel avec Anna, mais les démons y seront aussi et une bataille entre anges et démons. Anna en profita pour récupérer sa grâce qui était en possésion d'Uriel, et lorsque qu'elle le récupéra une lumière blanche accablante s'illuminait de son corps et elle disparaissa avec les démons.

Anna réapparaitra devant Dean, et elle lui dit qu'elle etait séquestrée et torturée dans le ciel, après que Castiel l'ait envoyée et qu'elle s'est échappé. Elle lui dit qu'elle ne peut pas le trouver et lui demande de venir la rejoindre quelque part avec Sam. Mais Castiel arriva à sa place, et découvrit qu'elle avait l'intention de tuer Sam, et Anna lui apprit qu'elle veut tuer Sam pour empêcher Lucifer de se servir de lui un jour. Castiel annonça à Anna que si elle tente de tuer Sam, celui-ci n'hésiterai pas à la tuer. Anna décida de remonter le temps, juqu'en 1978 afin de tuer les parents de Sam et Dean, et ainsi empêcher la naissance de Sam. Mais Castiel alla en 1978 avec Sam et Dean pour l'en empêcher, Anna fit appel a Uriel, mais à celui du passé pour l'aider à tuer les Winchester. Mais Michael intervint et renvoya Uriel au ciel et tua Anna.

Ruby est une mystérieuse jeune femme qui vient aider les frères Winchester dans leur mission. Elle possède une arme, un couteau, qui peut tuer les démons. Celle-ci est un démon et raconte à Sam qu'elle a de bonnes intentions et veut le préparer pour qu'il combatte seul le nouveau démon qui s'élève, Lilith, lui expliquant qu'il doit à tout prix changer pour pouvoir la combattre. Pour lui prouver qu'elle est digne de confiance, elle répare le Colt et dit qu'elle connait un moyen pour sauver Dean.

Quand Dean et Sam s'apprettent à tuer Lilith elle revient mais on apprend que c'est Lilith qui est dans le corps de Ruby est qu'elle a été renvoyée en enfer.

Après la mort de Dean, elle revient sur terre en disant à Lilith qu'elle serait un bon soldat mais c'est un mensonge car elle revient vers Sam. Mais celui-ci ne veut plus l'écouter et afin d'être sur qu'il l'écoute, elle possède le corps d'une fille qui est morte cérébralement. Elle va chercher à lui prouver qu'elle ne fait de mal à personne. Elle lui suggère plus tard d'utiliser ses pouvoirs, avait déjà demandé pour pouvoir tuer Lilith. Touché par son aide, il se prend de sympathie pour elle et finissent par coucher ensemble et il apparait que Ruby éprouve des sentiment envers Sam. Elle lui est loyale et ne sert que ses intérêt.

Mais quand Dean revient à la vie, elle préfère s'écarter de Sam pour éviter les réprimandes de Dean, mais Sam restera en contact avec elle, et elle le verra en secret pour ne pas éveiller de soupçons.

Elle donnera de son sang à Sam pour qu'il deviennent plus puissant, elle le manipulera jusqu'à la fin de la saison 4. Mais en réalité c'est une traîtresse, elle s'est servie de Sam pour qu'il tue Lilith, qui est en réalité le dernier sceau à détruire. En se rendant compte que Ruby l'a trahi, il la tiendra pendant que Dean, à l'aide du couteau, la tuera.